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10月15日下午,中国科学院上海营养与健康研究所所级科学数据中心举办了“生物元数据治理与管理平台应用”培训,旨在帮助科研人员了解和掌握生物元数据治理的关键技术和方法,通过有效的元数据治理策略,提升生物样本数据的可用性和研究价值。本次培训由中心吴祉乐工程师担任主讲人。

吴祉乐首先系统地介绍了生物元数据的概念、类型及其在科学研究中的关键作用。生物元数据是指描述生物样本或实验条件特性的数据,对于理解复杂的生物信息至关重要。这些数据包括样本采集时间、地点、环境特性以及宿主状态等关键信息,为后续的数据分析提供了必要的上下文。然而,随着生物数据量的不断增长,不同数据库之间存在的技术差异和组织架构差异导致了数据整合难、利用效率低等问题。

针对这些挑战,吴祉乐重点讲解了中心提出的一套系统的组学样本元数据治理策略。该策略包括从主流生物样本组学数据库中收集大量的元数据;设计稳定且兼容性强的数据架构来重组元数据;基于实际需求建立如水圈数据标准等的数据规范;最后,通过数据消歧、填补和标准化等一系列措施对元数据进行治理,并将处理后的元数据回流至原始数据库以确保长期有效性。吴祉乐还以水圈数据集为例对该策略进行了详细说明。

为了更好地解决上述问题,所级科学数据中心开发了国际生物组学元数据管理平台AntNest(https://www.biosino.org/antnest),吴祉乐在培训现场进行了展示。该平台以“蚂蚁搬家”的方式实现国际公共数据库中海量组学原始测序数据的下载、本地化、整合、归档和管理。旨在促进全球范围内生物数据资源的有效管理和利用。

培训过程中,学员们积极参与,踊跃发言,并与吴祉乐就元数据治理的具体技术细节进行了深入讨论。通过此次培训,科研人员不仅提升了对生物元数据治理重要性的认识,也掌握了一系列实用的方法论指导。

营养与健康所所级科学数据中心将持续举办相关主题的培训活动,以帮助更多的科研人员了解中心提供的保全、保供、增值、定制等四类服务。同时,所级科学数据中心还设计了相关的调研问卷(详见文末二维码),诚邀科研人员提出宝贵的意见和建议,以便进一步优化和提升服务质量。通过与科研人员的积极互动和反馈,中心将不断改进服务流程,提升技术支持质量,为进一步满足科研需求提供更加优质的服务。


国际生物组学元数据管理平台


吴祉乐作培训报告


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