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8月27日下午,中国科学院上海营养与健康研究所所级科学数据中心举办了“生物医学知识图谱构建技术”培训,旨在帮助科研人员了解和掌握生物医学知识图谱构建技术。本次培训由中心高级工程师凌鋆超担任主讲人,其研究方向为生命组学数据库/知识库建设与生物信息学分析,目前主要负责健康医疗和生物医学数据库研发方向的架构设计与研发,成果包括中国人群动态基因组数据库、NODE国家组学数据百科全书、PGG.SV结构变异数据库在内的多项生命科学数据库资源,作为项目骨干还参与了多项国家重点研发计划等并积累了丰富的经验,曾在Nucleic Acids ResearchScience BulletinBioinformatics等期刊发表多篇基因组学和数据库相关文章。

凌鋆超首先介绍了数据库、知识库和知识图谱的概念及区别。随后,他分析了常见的知识图谱类型、知识图谱的典型应用、构建的关键技术、构建的必要性、构建问题以及知识表示框架等内容。此外,他还详细介绍了中心已经构建的精准药物知识图谱CPMKG、结核分枝杆菌免疫原知识图谱、以及基于自然语言垂直大模型的知识图谱的背景、建设流程及应用,着重介绍了基于大模型的结核抗原知识图谱。最后,他从数据、大模型和下游任务三个方面对知识图谱进行了总结,并展望了未来的发展方向。

培训过程中,学员们积极参与,踊跃发言,并与主讲人进行了深入交流和讨论,更深入地学习了所级科学数据中心基于大模型和知识模式驱动的条件知识图谱方面的工作,进一步了解到中心可以提供的数据库和工具软件开发服务,为科学研究提供了有力支持。

营养与健康所所级科学数据中心将持续举办相关主题的培训活动,以帮助更多科研人员了解中心提供的保全、保供、增值、定制等四类服务。同时,所级科学数据中心还设计了相关调研问卷(详见文末二维码),诚邀科研人员提出宝贵意见和建议,以便进一步优化和提升服务质量。通过与科研人员的积极互动和反馈,中心将不断改进服务流程,提升技术支持质量,为进一步满足科研需求提供更加优质的服务。


凌鋆超高级工程师作培训报告

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