7月24日下午,中国科学院上海营养与健康研究所所级科学数据中心举办了“单细胞转录组数据高级分析进阶”培训,旨在帮助科研人员了解和掌握相关技术和工具,以提升自身生物信息分析能力。本次培训由中心资深工程师黄俞玮担任主讲人,其研究方向为生物信息学大数据分析和流程搭建,目前主要负责单细胞及空间转录组方向的分析工作。
黄俞玮首先向学员们介绍了单细胞转录组应用方向及示例,包括细胞类型及功能、细胞群的数量及比例特征、细胞群的特征基因及功能、细胞群间的发育顺序、细胞群间的相互作用。随后,她详细介绍了ViPMAP(https://www.biosino.org/vipmap/home)单细胞转录组数据高级分析实操,包括高级分析参数解析及任务提交管理、分析结果解读。
培训过程中,学员们积极参与,踊跃发言,并与主讲人在关键技术和方法上进行了深入交流和讨论,比如是否可以进行Cell Chat分析、如何比较Case和Control组数据,以及如何整合和去除批次效应等。通过此次培训,学员们不仅对单细胞转录组的应用有了更深入的了解,还掌握了ViPMAP单细胞转录组数据高级分析的实际操作,包括高级分析流程的操作及分析报告的生成与解读等。这将进一步提升学员们对所级科学数据中心提供的常规生物信息分析服务的了解,为科学研究工作提供有力支持。
营养与健康所所级科学数据中心将持续举办相关主题的培训活动,以帮助更多的科研人员了解中心提供的保全、保供、增值、定制等四类服务。同时,所级科学数据中心还设计了相关的调研问卷(详见文末二维码),诚邀科研人员提出宝贵的意见和建议,以便进一步优化和提升服务质量。通过与科研人员的积极互动和反馈,中心将不断改进服务流程,提升技术支持质量,为进一步满足科研需求提供更加优质的服务。
黄俞玮资深工程师作培训报告