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1月9日下午,中国科学院上海营养与健康研究所所级科学数据中心举办了“生物医学知识图谱构建技术”培训,旨在帮助科研人员了解和掌握生物医学知识图谱构建技术。本次培训由中心高级工程师凌鋆超担任主讲人,凌鋆超的研究方向是生命组学数据库/知识库建设与生物信息学分析,他目前主要负责健康医疗和生物医学数据库研发方向的架构设计与研发,研发了包括中国人群动态基因组数据库、NODE国家组学数据百科全书、PGG.SV结构变异数据库在内的多项生命科学数据库资源。此外,他还作为项目骨干参与了多项国家重点研发计划项目,并积累了丰富的项目经验。曾在Nucleic Acids ResearchScience BulletinBioinformatics等期刊发表多篇基因组学和数据库相关文章。

凌鋆超首先介绍了数据库、知识库和知识图谱的概念及区别,并对知识图谱进行了基本的介绍。随后,他介绍了常见的知识图谱以及知识图谱的典型应用、构建的关键技术、构建知识图谱的必要性和常见问题。此外,他还详细介绍了中心已经构建的基于条件的精准药物知识库、结核分枝杆菌免疫原知识图谱等。最后,凌鋆超通过数据、大模型和下游任务三个方面对知识图谱进行了总结和未来发展展望。

在培训过程中,学员们积极参与,踊跃发言,并与凌鋆超就知识图谱下游预测、如何界定知识的可靠性以及如何解读知识图谱等问题进行了深入交流和讨论。这次培训使学员们更深入地了解了所级科学数据中心基于大模型和知识模式驱动的条件知识图谱方面的工作,并了解到中心可以提供的数据库和工具软件开发服务,为科学研究提供了有力支持。

营养与健康所所级科学数据中心将继续举办相关主题的培训活动,以帮助更多的科研人员了解中心提供的保全、保供、增值、定制等四类服务。同时,所级科学数据中心也欢迎科研人员提出宝贵意见和建议,以进一步完善和提升服务质量。通过与科研人员的积极互动和反馈,中心将不断改进服务流程和技术支持,以满足科研人员的需求,为科研人员提供更加优质的服务。


凌鋆超高级工程师作培训报告

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