生物医学大数据中心致力于有机结合生物医学大数据面向国家及社会的工程化服务与面向科学技术前沿的创新研究，积极推进生物医学大数据在人口健康、精准医学、微生物学等方面的数据体系、分析体系和应用体系的建设。大数据中心的定位包括：

1） 研发海量优质数据、快速专业计算、整合智能的新型大数据平台，建设安全稳定长效可靠的生物医学大数据中心；

2） 面向生物与健康医疗大数据，提供集成、治理、管理和分析等全流程的数据服务；

3） 依托数据安全整合、存储共享和计算挖掘的技术支撑体系，打造全国性的大数据资源协作网络；

4） 推动数据密集型的知识发现研究，促进生命、医学、工程、技术多学科融合，提升“会聚研究”能力。

在致力于提供开放共享的数据基础性工作的同时，生物医学大数据中心同时开展所级科学数据中心的工作，加强和规范研究所的科学数据管理，保障科学数据安全，提高科学数据开放共享水平。所级科学数据中心坚持契合中国科学院科学数据中心体系建设规范，面向所内提供科学数据“保全、保供、增值、定制”四类服务，包括科学数据安全保存与汇交（保全），非公开数据的转移、获取与保存（保供），科学数据目录与应用，基础数据分析（增值）、高级定制数据分析与软件开发（定制）。

生物医学大数据中心（所级科学数据中心）管理架构实行“中国科学院上海营养与健康研究所网信领导小组及其管理职能部门（管）,所级科学数据中心主任及数据服务生信服务、资源共享（办），网信领导小组授权管理职能部门及网络部（监）”分离体系。下设数据库研发平台（数据服务组）、生物信息分析平台（生信服务组）、高性能存储与计算平台（资源共享组）。

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