邮箱: andrew@sinh.ac.cn
电话: +86-21-54920659
研究组主页: https://aet21.github.io
所属部门: 中国科学院计算生物学重点实验室
工作经历：
2013年-至 今：中国科学院上海营养与健康研究所/中国科学院计算生物学重点实验室研究组长，计算系统表观基因组学研究员
2008年–2019年：英国伦敦大学学院癌症研究所，Heller Research Fellow担任Principal Research Associate（2008年–2010年），后担任组长（2010年–2013年），英国皇家学会Newton Advanced Fellow（2015年–2019年），Honorary Research Fellow
2013年–2019年：中国科学院–马普学会计算生物学伙伴研究所（中国科学院上海生命科学研究院计算生物学研究所）研究组长，计算系统表观基因组学研究员
2003年–2008年：英国剑桥大学肿瘤系乳腺癌功能基因组学实验室（Carlos Caldas教授领衔），Senior Postdoctoral Fellow
2001年–2003年：University of Warwick数学研究所数学生物学研究组（David A. Rand教授领衔），Research Assistant
2000年–2001年：British Telecom实验室复杂性研究组（Sverrir Olafsson博士领衔），成员
教育背景：
1996年–2000年：英国剑桥大学，博士学位，理论粒子物理专业
1995年–1996年：英国剑桥大学，Certificate of Advanced Study，数学专业，Awarded Distinction
1990年–1995年：英国爱丁堡大学，学士学位，数理物理学专业，Awarded 1st Class (Tait Medal)
计算系统表观基因组学
研究方向主要是统计生物信息学，主要关注癌症表观基因组学和癌症系统生物学的统计学分析。研究的目的是应用创新的计算学方法帮助理解肿瘤形成并开发新的一般癌症风险预测和早期诊断工具。
1. Chang J*, Lu J, Liu Q, Xiang T, Zhang S, Yi Y, Li D, Liu T, Liu Z, Chen X, Dong Z, Li C, Yi H, Yu S, Huang L, Qu F, Wang M, Wang D, Dong H, Cheng G, Zhu L, Li J, Li C, Wu P, Xie X, Teschendorff AE*, Lin D*, Wang X*, Wu C*. Single-cell multi-stage spatial evolutional map of esophageal carcinogenesis. Cancer Cell 2025 Mar;43(3):380–397.e7.
2. Teschendorff AE*, Horvath S*. Epigenetic ageing clocks: statistical methods and emerging computational challenges. Nat Rev Genet 2025 May;26(5):350–368.
3. Tong H, Dwaraka VB, Chen Q, Luo Q, Lasky-Su JA, Smith R, Teschendorff AE*. Quantifying the stochastic component of epigenetic aging. Nat Aging 2024 Jun;4(6):886–901.
4. Zhu T, Liu J, Beck S, Pan S, Capper D, Lechner M, Thirlwell C, Breeze CE*, Teschendorff AE*. A pan-tissue DNA methylation atlas enables in silico decomposition of human tissue methylomes at cell-type resolution. Nat Methods 2022 Mar;19(3):296–306.
5. Teschendorff AE*, Feinberg AP*. Statistical mechanics meets single-cell biology. Nat Rev Genet 2021 Jul;22(7):459–476.
6. Teschendorff AE*. Avoiding common pitfalls in machine learning omic data science. Nat Mater 2019 May;18(5):422–427.
7. Zheng SC, Breeze CE, Beck S, Teschendorff AE*. Identification of differentially methylated cell types in epigenome-wide association studies. Nat Methods 2018 Dec;15(12):1059–1066.
8. Teschendorff AE*, Relton CL*. Statistical and integrative system-level analysis of DNA methylation data. Nat Rev Genet 2018 Mar;19(3):129–147.
9. Teschendorff AE*, Enver T. Single-cell entropy for accurate estimation of differentiation potency from a cell's transcriptome. Nat Commun 2017 Jun;8:15599.
10. Zheng SC, Beck S, Jaffe AE, Koestler DC, Hansen KD, Houseman AE, Irizarry RA, Teschendorff AE*. Correcting for cell-type heterogeneity in epigenome-wide association studies: revisiting previous analyses. Nat Methods 2017 Feb;14(3):216–217.
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